В езерото и около него има тръстика и други водолюбиви растения. Растителното съобщество от тръстика заема около 2/3 от площта на резервата. Тук се срещат 139 вида висши растения, като 11 от тях са редки или застрашени от изчезване извън територията на Сребърна. Вторият по разпространеие растителен вид е тънколистния папур следван от широколистния папур . Сивата и червената върба също са широко разпространен. Животинският свят в резервата е много разнообразен.
Въпреки богатата флора „Сребърна” е известен преди всичко с фауната. Тук се охраняват местообитанията на близо 190 вида птици, не малка част от които гнездят в самото езеро, включително и колония от къдроглави пеликани. Това е уникален за науката, застрашен от изчезване вид, включен в Международната червена книга, в Застрашените птици на Европа. В българската Червена книга е вписан в категория „уязвим”.Срещат се 41
вида бозайници, 11 вида влечуги и 10 вида земноводни и 24 вида риби.